חורבת יתיר (בעברית: חורבת יַתִּיר) הוא אתר ארכיאולוגי במדבר יהודה בדרום ישראל. הממוקם ביער יתיר, כ-10 קילומטרים דרומית לעיר קרית גת. האתר מזוהה עם העיר המקראית ג'תיר, שהייתה אחת מערי המקלט הלוים.
חורבות חורבת יתיר מתקופת הברזל ב' (מאות ט-ו' לפנה"ס), התקופה הביזנטית (מאות ד'-ז' לסה"נ) והתקופה הממלוכית (מאות 13-16 לספירה). האתר כולל שרידי בית כנסת, כנסייה, מבצר ועוד מספר מבנים.
בית הכנסת בחורבת יתיר הוא אחד מבתי הכנסת הוותיקים והשמורים בישראל. הוא נבנה במאה ה-4 לספירה ומאמינים שהיה בשימוש עד המאה ה-7 לספירה. בית הכנסת הוא מבנה חד-חדר עם ספינה מרכזית ושני מעברים צדדיים. קירות בית הכנסת מעוטרים בסדרת ציורי קיר המתארים סצנות מקראיות.
הכנסייה בחורבת יתיר נבנתה במאה ה-6 לספירה, ומאמינים שהייתה בשימוש עד המאה ה-7 לספירה. הכנסייה היא בזיליקה בעלת שלושה פסים עם ספינה מרכזית ושני מעברים צדדיים. הכנסייה מעוטרת בסדרה של פסיפסים המתארים סצנות תנ"כיות.
המבצר בחורבת יתיר נבנה בתקופה הממלוכית ומאמינים שהיה בשימוש עד המאה ה-16 לספירה. המצודה היא מבנה מרובע עם ארבעה מגדלים בכל פינה. המבצר מוקף בחפיר.